【BCJ】menin抑制剂治疗的急性白血病患者中使用游离DNA检测MEN1耐药突变

时间:2026-07-28 21:23:47   热度:37.1℃   作者:网络

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Menin抑制剂(如revumenib、ziftomenib)已获批用于治疗携带KMT2A重排或NPM1突变的急性白血病,这类患者依赖Menin-KMT2A相互作用维持致癌转录程序。但获得性耐药会限制疗效持久性,其中MEN1基因突变是常见的“靶内”耐药机制,突变后药物结合受损但Menin的促癌支架功能仍保留。

目前依靠骨髓穿刺获取基因组DNA进行二代测序,但骨髓活检具有侵入性,不易于频繁监测,尤其在儿童或血细胞极低的患者中。纪念斯隆凯特琳癌症中心学者开发了一种名为MSK-ACCESS MEN1的靶向捕获NGS检测 panel,应用于 menin 抑制剂治疗的急性白血病患者游离 DNA 中 MEN1 耐药突变的检测。

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研究方法

检测技术:开发了名为MSK-ACCESS MEN1的靶向捕获NGS检测 panel,在已验证的MSK-ACCESS HeMe血浆cfDNA检测骨架基础上,增加了覆盖MEN1基因全部9个外显子的探针。

性能验证:与骨髓来源gDNA的标准检测(MSK-IMPACT HeMe)进行对比,两者在MEN1突变检出和等位基因频率(VAF)上高度一致(Pearson相关系数0.979)。

研究对象:收集接受menin抑制剂治疗且出现耐药的急性白血病患者的纵向血浆样本,评估cfDNA检测耐药突变的可行性。

研究结果

白细胞极低/无循环原始细胞时仍可检出:一例KMT2A重排T-ALL患者,骨髓原始细胞56%但外周血白细胞仅0.16 k/μL且无原始细胞,血浆cfDNA仍能检出全部3种MEN1耐药突变(G331D、G331R、M327I),与骨髓结果完全一致。

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提前于骨髓发现早期克隆演变:一例KMT2A重排AML患者,治疗中骨髓原始细胞降至6%且骨髓测序阴性,但同期血浆cfDNA已检出低VAF的T349M(1.0%)和G331D(0.16%)耐药突变,8天后即出现疾病进展,骨髓才检出T349M(VAF 11%)。

提前多个周期预警临床进展:

例1(NPM1突变AML):第4周期开始时骨髓稳定(11%原始细胞)、骨髓测序阴性,但血浆cfDNA检出低VAF(1.6%)的M327V突变,该周期结束后即快速进展,骨髓才检出M327V和M327I。

例2(KMT2A重排AML):患者在深度缓解(MRD阴性)期间,第11周期初血浆cfDNA检出极低VAF(0.18%)的M327I突变,比骨髓确认进展(第13周期末,原始细胞68%)提前了约3个周期。

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总结

血浆cfDNA检测可可靠、灵敏地识别menin抑制剂治疗中出现的MEN1耐药突变。

该技术有望用于动态监测耐药克隆演化,指导早期干预和适应性治疗策略调整。

在现有panel基础上灵活添加新发现耐药基因探针,具有良好的临床可扩展性。

cfDNA检测优势:

无创、可重复采样,尤其适合儿童和血细胞减少患者。

灵敏度高,能检出骨髓测序因肿瘤细胞含量不足而漏检的低频亚克隆。

可提供数周至数月的预警窗口期,早于形态学复发和标准骨髓测序。

研究局限性:单中心、样本量有限,需在更大规模前瞻性临床试验中验证。

参考文献

Blood Cancer J . 2026 Jun 16;16(1):94. doi: 10.1038/s41408-026-01545-4.

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