非结核分枝杆菌又叫非典型分枝杆菌。由于具有抗酸染色阳性特性，所以又称为抗酸菌。它在外界环境中广泛地存在(包括土壤、牛奶、消毒水、动物体表以及体液等)，并且可以污染多种水源，特别是医院中的试剂和冲洗液，因此已经成为医院感染中最常见的细菌之一。
 
 
非结核分枝杆菌具有很强的疏水性。菌细胞壁外层膜孔的蛋白通道非常的狭窄，使得药物难以进入非结核分枝杆菌的菌体里面;而且快速生长型的非结核分枝杆菌具有很强的β-内酰胺酶活性，可以导致β-内酰胺类抗生素失去其抗微生物的活性，并且产生耐药性，因此青霉素类及头孢菌素类的抗生素对非结核分枝杆菌的治疗是无效。对于早期的非结核分枝杆菌角膜炎，大多数情况之下首选阿米卡星滴眼液，它属于氨基糖苷类抗生素。在低浓度的情况下，阿米卡星抑制着非结核分枝杆菌的生长，高浓度的时候则具有较强的杀菌作用。阿米卡星滴眼液浓度一般为1%~2%，每30分钟一次，连续使用48小时之后要减量;中、重度患者可以再给予结膜下注射4%阿米卡星0.5ml;一般是不全身用药。氟喹诺酮类的抗生素对非结核分枝杆菌有较强的抗菌活性，第四代氟喹诺酮类中，加替沙星的效果最好，眼药水浓度为0.3%。而且角膜毒性较氨基糖苷类抗生素低。由于本病的治疗时间比较长，为了防止产生耐药，须要联合用药，通常用0.8%阿米卡星眼水或者是1%克拉霉素眼水与0.3%左氧氟沙星眼水联合点眼，可以呈现出明显的协同作用。
 
 
对于使用上述的药物治疗无效的患者或者是中重度的患者，这被认为最好的治疗是早期去掀开角膜瓣，立即取材涂片镜检明确病原菌，如果为非结核分枝杆菌就用0.8%阿米卡星或是1%克拉霉素溶液冲洗角膜瓣及基底床;无条件取材镜检者可以选用广谱的抗生素，如妥布霉素或者是先锋霉素进行冲洗。
 

 
 
尽管采取积极的局部治疗，仍然有64%的患者因为药物不敏感而须要手术治疗，手术包括角膜瓣切除手术和板层角膜移植手术。瓣切除的手术指征是疏松的角膜瓣不能和角膜基质附着;临床症状不能得到缓解，对药物治疗的反应差。瓣切除既可以提高局部药物的浓度，又能破坏非结核分枝杆菌的生存环境，消除瓣与基质间的小腔隙，使得炎症得到控制。瓣切除患者在炎症控制之后为提高矫正视力可以进行角膜板层移植手术。
 
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