背景
肺动脉高压（PAH）是一种严重的进行性疾病，其特征是肺血管阻力的逐渐增加，最终导致右心室功能衰竭并可能危及生命。尽管在改善患者生活质量和延缓疾病进展方面已有多种治疗方法，但PAH的总体预后仍不理想，死亡率较高。近年来，研究人员逐渐认识到线粒体功能障碍在PAH病理生理过程中的重要作用。线粒体作为细胞的“能量工厂”，在氧化磷酸化、能量代谢和细胞信号调控中起关键作用，其功能异常可能会直接影响细胞增殖、凋亡及炎症反应。然而，目前关于PAH中线粒体功能改变的关键机制和分子基础仍未完全明确。为深入探讨线粒体在PAH发病中的作用，我们进行了多组学整合分析，以揭示潜在的病理机制和治疗靶点。

方法
本研究整合了基因表达综合数据库（GEO）中的三个微阵列数据集，共包含222个肺组织样本，其中PAH样本164例，对照样本58例。通过差异表达分析和功能富集分析筛选线粒体相关通路，并利用机器学习算法识别与PAH病理过程密切相关的线粒体信号通路。此外，收集了PAH患者和对照组的肺组织样本，进行转录组和代谢组分析。通过京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，探索共享的功能通路；通过典型相关分析，评估线粒体相关基因与差异代谢物之间的关系，从分子和代谢两个层面揭示关键机制。

结果
在整合的GEO数据集中，分析发现PAH样本中与线粒体功能相关的信号通路显著富集，尤其是线粒体氧化磷酸化系统中的电子传递链（ETC）。进一步分析表明，ETC中从细胞色素c到氧的电子传递过程被显著下调，这一过程对于线粒体产生ATP和维持细胞能量平衡至关重要。转录组分析结果揭示了14个与线粒体功能相关的差异表达基因（DEGs），其中包括KIT、OTC、CAMK2A和CHRNA1等关键基因，这些基因可能通过调控细胞代谢和信号传导直接参与PAH的病理过程。

代谢组分析结果显示，与对照组相比，PAH样本中3种代谢物水平显著改变：3-苯乳酸和ADP水平升高，而柠檬酸水平下降。柠檬酸作为三羧酸循环的关键中间产物，其减少可能表明线粒体能量代谢的紊乱。此外，进一步的基因-代谢物相关性分析表明，3-苯乳酸水平的升高与线粒体相关基因表达密切相关，这提示其可能是PAH的一种潜在分子标志物。

讨论
本研究综合多组学数据揭示了线粒体功能障碍在PAH发病中的核心作用。电子传递链（ETC）中从细胞色素c到氧的电子传递下调可能是PAH病理过程中的关键环节。ETC功能的削弱不仅会导致ATP生成减少，还可能引起活性氧（ROS）水平的升高，从而加剧肺血管内皮细胞的损伤及平滑肌细胞的增殖。此外，柠檬酸循环中柠檬酸水平的下降反映了能量代谢的紊乱，可能进一步推动了PAH的进展。

值得注意的是，3-苯乳酸作为一种潜在的新型诊断生物标志物，其升高可能反映了PAH患者代谢状态的异常变化。未来的研究可进一步探索3-苯乳酸在疾病分期和疗效监测中的应用价值。此外，本研究还鉴定了多种与线粒体功能相关的关键基因，如KIT和OTC，这些基因可能成为PAH治疗的新靶点。

结论
本研究通过多组学整合分析，发现PAH患者中线粒体电子传递链功能受损以及柠檬酸循环稳态的破坏可能是疾病进展的重要机制。同时，鉴定了3-苯乳酸作为PAH潜在诊断生物标志物的意义。这些发现不仅加深了我们对PAH发病机制的理解，还为开发新的治疗和诊断策略提供了有力的科学依据。未来研究可进一步验证这些分子机制，并评估基于线粒体功能恢复的治疗策略在临床中的潜力。

原始出处：

Zhang X, Li J, Fu M, Geng X, Hu J, Tang KJ, Chen P, Zou J, Liu X, Zeng B. Dysfunction in mitochondrial electron transport chain drives the pathogenesis of pulmonary arterial hypertension: insights from a multi-omics investigation. Respir Res. 2025 Jan 20;26(1):29. doi: 10.1186/s12931-025-03099-8. PMID: 39833797; PMCID: PMC11749457.