滴虫性阴道炎发病机制不仅取决于滴虫本身，而且由于滴虫与阴道乳酸杆菌拮抗，从而使阴道黏膜乳酸杆菌减少，导致阴道酸碱度升高，造成其他细菌如厌氧菌大量繁殖，引起混合感染，因此，积极彻底治疗滴虫性阴道炎。

滴虫性阴道炎既要抗滴虫，又要抗细菌。只要应用抗滴虫药同时合用抗厌氧菌药，随着滴虫减少，乳酸杆菌占优势，阴道内环境改善，很快可恢复正常。治疗滴虫性阴道炎的药物主要是甲硝唑、硝基丙唑、替硝唑等。有针剂、片剂和栓剂。

滴虫感染常在夫妻间呈乒乓球式传来传去，因此双方应同时治疗。感染滴虫后有的患者没有症状，因此在健康检查时应注意阴道内有否滴虫，如有，即使没有症状也要治疗。男性从生殖器上检查滴虫非常困难，只要女性被证明已感染，男性即使检查为阴性，也必须同时治疗，才能彻底治愈。

孕妇患滴虫性阴道炎不能口服甲硝唑和替硝唑类药物，因为这类药物可通过胎盘进入胎儿体内，影响胎儿发育。经研究，局部使用甲硝唑栓剂，仅在妊娠晚期有限地进入孕妇血内，因此比较安全。阴道栓剂可连续使用10～11天。使用甲硝唑期间不得饮酒，否则可引起腹痛、呕吐和颜面潮红等不良反应。孕妇滴虫性阴道炎发病较少，其原因是在妊娠期女性激素分泌亢进，阴道黏膜细胞内糖原丰富，乳酸杆菌呈优势，滴虫不能大量繁殖。

如何判断滴虫性阴道炎已经痊愈，主要根据自觉症状消失，同时阴道滴虫呈阴性(尽可能通过培养确认)。甲硝唑治愈率可高达90%～95%，被认为是治疗滴虫性阴道炎的良好药物。如果和配偶同时治疗，预后必然有把握。