肝炎发生的原因，大部分是由于乙肝病毒入侵，但乙肝病毒入侵人体发生感染后，能否引起肝炎，却不单单全由乙肝病毒取决，其实更重要的是人体自身免疫系统对乙肝病毒产生的反应。如果没有药物等外在作用，一般会经历四个时期。
 
 
　　在乙肝病毒感染人体后，病毒大部分生存在肝细胞内。处于这一时期，人体的免疫监控系统会还识别不出乙肝病毒，把它错误地认为是“自己人”，与它和平共处，所以不会对乙肝病毒进行清除。这些病毒可以在肝细胞内自由复制，暂时不影响肝细胞的正常功能，肝脏也没有炎症表现。乙肝携带者就处于这种免疫耐受状态。
 
 
　　乙肝病毒在人体内都有一段潜伏时间，每个人的潜伏时间不同，在潜伏时间里面，我们自身的免疫监控系统会开始慢慢发现“敌情”，并开启免疫反应，产生相对应的免疫细胞和抗体等免疫物质。这些抗体能够识别出乙肝病毒的抗原，并与之结合，形成免疫复合物。这些免疫复合物会被体内的吞噬细胞吞噬，然后排出到细胞外。我们可以将肝细胞想象成一间屋子，乙肝病毒是溜进来的一群小偷，人体的免疫系统是屋子里面的监控器，免疫物质就是警察。当监控系统报警时，就会从屋子的各个方向涌来一批警察。警察和小偷打起来了，屋子里面的门窗家具就容易被打破。因此，处于免疫清除期的肝细胞会出现炎症反应，就是因为病毒和免疫系统“打架”，把肝细胞里打得一片狼藉。肝细胞“受伤”了，就会出现炎症反应。这时候，肝细胞的细胞膜通透性会发生改变甚至被损坏，细胞内的转氨酶就会进入血液。做肝功能检查时会发现血清里的转氨酶明显变多了(也就是ALT水平升高)，这是一个信号，告诉我们肝炎可能发作了，携带者可能发展为乙肝患者了。此时就应该考虑抗病毒治疗。
 
 
　　在经过激烈的抗斗后，免疫系统已经把一部分乙肝病毒清除掉，另外也可以通过积极的药物治疗将病毒清除。所谓病毒清除，是指血液里已经查不到乙肝病毒的DNA，但是肝脏内可能还会有部分病毒残留。这一时期，乙肝病毒处于非活动性携带状态，复制能力受到抑制，病毒含量低，因此暂时不会兴风作浪。
 
 
　　处于第四阶段期的肝炎患者，在某些诱因下，例如免疫力下降、做化疗等，乙肝病毒可能会重新活跃起来，肝脏重新出现炎症反应，也就是肝炎再次发作。
 
　　
 
　　总的来说，处于免疫清除期和再活动期的乙肝病毒感染者是最需要积极参加治疗的肝炎患者，而处于第一阶段和第三阶段的人，则暂时不需要治疗，但必须要定期复查，按时监测乙肝病毒和肝脏的情况，确保对于乙肝病毒的把控。
 
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