目前，HPV疫苗根据作用效果分为三类。第一类是预防性HPV疫苗，其目的是预防HPV感染，主要通过体液免疫起到预防作用，适用于未感染过HPV的年轻女性，一在多个国家上市;第二类是治疗性HPV疫苗，通过体液免疫或细胞免疫起到治疗作用，适用于已感染HPV或已有宫颈病变的患者，目前还处于研制阶段;第三种是兼具预防和治疗作用的HPV疫苗，目前尚未研究成功。专家也在努力研发具有覆盖更多HPV亚型的能力同时相对廉价和便于生产等优点的新一代预防性HPV疫苗。
 
 
预防性HPV疫苗最主要的目标人群是学龄儿童和青少年，在初次性生活前及HPV暴露前是最理想的接种时期。但是对这类人群接种疫苗是存在困难的，因为家长们可能认为接种疫苗有损健康。各个国家和地区建议的疫苗接种年龄不尽相同。这两种疫苗都可以用于9-12岁女性。在13-26岁女性中，建议从未接种疫苗者应接种疫苗。由于疫苗对没有性行为人群的预防作用效果最好，HPV疫苗除了适用于此年龄段女性外，四价疫苗也适用于9-26岁男性生殖器疣的预防。由于30%的宫颈癌不是由HPV16/18引起，而是由其他HPV高危亚型引起，对于已接种HPV疫苗的女性仍需继续进行常规宫颈癌的筛查。在美国，疫苗不建议用于年龄大于 26岁的女性。
 

 
 
接种预防性HPV疫苗可使CIN发生率降低95%;CINⅡ～Ⅲ、原位癌发生率降低67%，证实HPV疫苗可明显降低CIN及宫颈癌发生率。
 
国外研究表明，一部分人接种疫苗后出现了一些毒副作用，但94%被认为是不严重的，包括注射部位疼痛、头痛、发热、皮疹、头晕、晕厥、恶心等;仅有6%被认为是严重不良反应事件，包括格林-巴利综合征，静脉血栓栓塞和死亡，但上述严重不良事件与HPV疫苗无明显因果联系。此外，亦未见HPV疫苗增加相关疾病发生率的循证医学证据。
 
目前hpv疫苗还存在许多问题，如果因为过于相信接种疫苗后可免于HPV感染或者宫颈癌而忽视定期检查，这是不可取的。任意一种疫苗的保护时间是有限的，并且HPV疫苗无法防御所有类型的HPV亚型感染。并且HPV疫苗由于价格过高，它的推广普及也存在一定难度，尤其是在发展中国家。