加权基因共表达网络分析揭示了与肺动脉高压相关的枢纽基因
时间:2023-02-10 15:01:39 热度:37.1℃ 作者:网络
研究背景
肺动脉高压(PH)是一种心肺血管疾病,急性危害人类健康,并可能是致命的。它进展迅速,死亡率高。它的病理生理学很复杂,仍未完全阐明;因此,实现治疗上的突破很困难。
研究方法及结果
在这项研究中,从基因表达总库(GEO)的GSE24988、GSE113439和GSE117261数据集中提取了58名正常对照组和135名PH患者的数据,并筛选出差异表达的基因(DEGs)。此外,还进行了基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)的途径富集分析。加权基因共表达网络分析(WGCNA)被用来识别与PH相关的关键模块和枢纽基因。确定了八个与PH相关的枢纽基因。此外,还进行了免疫细胞浸润和枢纽基因之间的相关性分析,接受者操作特征(ROC)曲线显示,TARDBP具有最佳的诊断功效。
另外,我们还建立了大鼠缺氧性肺动脉高压(HPH)模型,并利用Western blotting检测验证了枢纽基因在HPH大鼠肺部和肺动脉的表达。我们的结果显示,mTOR、PSMD2、RBM8A、SMARCA4、TARDBP和UBXN7在肺部高度表达。此外,与对照组相比,EFTUD2、mTOR、RBM8A、SMARCA4、TARDBP和UBXN7在HPH大鼠的肺动脉中明显上调,而DDB1则明显下调。